Im Bereich Naturschutz betreut das Forstamt unter anderem vier FFH Gebiete (Schutzgebiete nach EU-Richtlinie) und sechs Naturschutzgebiete mit folgenden Aufgabenschwerpunkten:

1. Aufstellung der Jahrespflegepläne
2. Darstellung der Gebiete in der Öffentlichkeit
3. Ausschreibung und Durchführung der Pflegemaßnahmen

Hinzu kommen Maßnahmen im Arten- und Biotopschutz, die im Rahmen der forstlichen Bewirtschaftung durchgeführt werden. Darüber hinaus engagiert sich das Forstamt auch in folgenden Projekten:

1. Entwicklung von Konzepten zur Erhaltung wertvoller und seltener Baumarten für künftige Generationen
2. Stilllegung besonders erhaltungswürdiger Waldbereiche und einzelner Altbäume
3. Mitwirkung bei der Ausweisung von Naturwaldreservaten, in denen die Forstwirtschaft eingestellt ist, zur wissenschaftlichen Erforschung der
4. unbeeinflussten Entwicklung natürlicher Prozesse im Ökosystem Wald
5. Arten- und Biotopschutz in Zusammenarbeit mit dem amtlichen und ehrenamtlichen Naturschutz