Elf Naturschutzgebiete mit insgesamt 853 ha Fläche werden im Auftrag der Oberen Naturschutzbehörde in Kassel vom Forstamt betreut. Von Halbtrockenrasenflächen mit Orchideen und dem blaublütigem österreichischen Lein auf kalkhaltigen Böden über Arnikabestände in den basaltbeeinflussten Hochlagen bis hin zum unberührten Waldgewässersystem des Breitenbaches wird die Verantwortung für die Schöpfungen der Natur wahrgenommen.

Daneben existieren die durch die Natura 2000-Verordnung ausgewiesenen FFH-Gebiete in den Flussauen Fulda, Lüder und Fliede. Rund 180 ha stehen hier für die Lebensräume des eingewanderten Bibers und den Schutz der Flussperlmuschel zur Verfügung.
Im Sinne des Naturschutzes hat das Land Hessen das 55 ha große Naturwaldreservat "Schönbuche" im Zentrum des Gieseler Forstes eingerichtet.