Die offizielle Meldung der NATURA 2000-Gebiete an die EU durch die Naturschutzverwaltung umfasst für Hessen insgesamt eine Gesamtfläche von 440.957 ha. 585 FFH-Gebiete und 60 Vogelschutzgebiete (VSG) mit folgender Aufteilung auf Offenland und Wald sowie Waldbesitzarten wie folgt (Teilflächen sind sowohl FFH- als auch Vogelschutzgebiet, wodurch sich in der Summe der Einzelflächen-Kategorien eine Differenz zur vorgenannten Gesamtfläche ergibt):

Die Gebietsmeldung unterstreicht die besondere naturschutzfachliche Bedeutung der hessischen Wälder. Staatswaldflächen werden künftig einen überproportionalen Beitrag zu diesem Schutzgebietssystem leisten.

Hessen-Forst übernimmt mit seinem Fachbereich Naturschutzdaten zentrale Aufgaben für das NATURA 2000-Management  im Bereich der Datenerhebung, Konzeption von naturschutzfachlichen Kartierungen, Qualitätssicherung und Aufbereitung von Daten. Darüber hinaus übernimmt Hessen-Forst im Auftrag der Oberen Naturschutzbehörden für die „Wald“-NATURA 2000-Gebiete Aufgaben der Managementplan-Erstellung und Umsetzung sowie Dokumentation.